Superkomputer virtual urun daya percepat riset virus

Washington (AFP) - Para gamer, para "penambang" bitcoin, dan perusahaan-perusahaan besar dan kecil bekerja sama dalam upaya kunyah-data yang baru kali ini terjadi yang bertujuan memanfaatkan daya komputasi belum terpakai guna mempercepat riset untuk pengobatan virus corona.

Proyek yang dipimpin oleh ahli biologi komputasi ini efektif menciptakan superkomputer paling kuat di dunia yang bisa menangani triliunan kalkulasi yang diperlukan untuk memahami struktur virus.

Lebih dari 400.000 pengguna mengunduh aplikasi ini dalam dua pekan terakhir dari "Folding @ Home," kata direktur Greg Bowman, profesor biokimia dan biofisika molekuler pada Universitas Washington di St. Louis, tempat proyek ini berpusat.

Upaya-upaya "komputasi terdistribusi" mengikat ribuan perangkat guna menciptakan superkomputer virtual.

Proyek yang awalnya diluncurkan di Stanford University 20 tahun silam itu dirancang untuk menggunakan daya komputasi urun daya untuk simulasi dalam upaya lebih memahami penyakit, terutama anomali "pelipat protein" yang bisa membuat patogen-patogen mematikan.

"Simulasi ini memungkinkan kami dapat mengamati bagaimana setiap atom bergerak sepanjang waktu," kata Bowman kepada AFP.

Analisis besar-besaran ini mencari "kantong-kantong" atau lubang-lubang pada virus di mana obat bisa diperas masuk.

"Tujuan utama kami adalah memburu situs-situs pengikat untuk terapi," kata Bowman.

Upaya komputasi berkuatan besar bisa menguji terapi-terapi obat potensial yang merupakan sebuah teknik yang dikenal sebagai desain obat komputasional.

Bowman mengatakan dia optimistis terhadap upaya ini karena tim sebelumnya menemukan sebuah target "bisa menjadi obat" dalam virus Ebola dan karena COVID-19 secara struktural mirip dengan struktur virus SARS yang telah menjadi subjek banyak penelitian.

"Peluang terbaik untuk masa depan yang dekat nanti adalah jika kita bisa menemukan obat yang sudah ada yang bisa terikat ke salah satu situs ini," kata dia.

"Jika itu terjadi, itu bisa segera digunakan."

Ini kemungkinan termasuk obat-obatan seperti obat antimalaria chloroquine dan hydroxychloroquine yang bisa "digunakan kembali" untuk COVID-19.

Bowman mengatakan proyek ini telah mampu meningkatkan kekuatannya menjadi sekitar 400 petaflop -masing-masing petaflop memiliki kapasitas untuk mengerjakan perhitungan satu kuadriliun per detik- atau tiga kali lebih kuat daripada superkomputer top dunia.

Superkomputer-superkomputer lain juga bekerja secara paralel. Laboratorium Nasional Oak Ridge mengatakan awal bulan ini bahwa dengan menggunakan superkomputer IBM yang paling kuat pihaknya telah mengidentifikasi 77 senyawa potensial yang bisa mengikat protein "lonjakan" virus corona yang utama guna melucuti patogen.

Proyek Folding @ Home dipersenjatai kekuatan komputasi urun daya dari desktop-desktop pribadi, laptop dan bahkan konsol-konsol PlayStation, selain juga dari komputer-komputer dan server-server bisnis lebih bertenaga.

"Tidak ada kata akhir dalam mengkomputasi kekuatan yang secara prinsipil bisa kita gunakan," kata Bowman. Perusahaan-perusahaan teknologi besar termasuk GitHub milik Microsoft juga berpartisipasi, dan proyek ini sedang dalam diskusi dengan yang lain.

Siapa pun yang memiliki komputer yang relatif baru bisa berkontribusi dengan memasang program yang mengunduh sejumlah kecil data guna dianalisis. Orang bisa memilih penyakit apa yang ingin digarapnya.

"Ini seperti penambangan bitcoin, tetapi untuk tujuan kemanusiaan," kata Quentin Rhoads-Herrera dari perusahaan keamanan Critical Start, yang menyediakan komputer hebatnya yang berkata sandi "hash cracker" yang dirancang untuk mendekripsi kata sandi-kata sandi untuk proyek ini.

Rhoads-Herrera mengatakan tim peneliti keamanannya yang kadang-kadang digambarkan sebagai "peretas topi putih" itu mengajak lebih banyak lagi orang untuk terlibat.

Pembuat chip komputer Nvidia, yang membuat prosesor grafis yang kuat untuk perangkat-perangkat game, juga meminta para gamer untuk bergabung dengan upaya ini.

"Responsnya luar biasa hebat, dengan puluhan ribu pengguna baru," bergabung (dalam upaya ini), kata juru bicara Nvidia Hector Marinez.

Salah satu sumbangan terbesar berasal dari kelompok penggemar dan gamer Reddit PC yang beranggotakan sekitar 24.000 gamer.

"Ini senjata fantastis untuk melawan perasaan tidak berdaya," kata Pedro Valadas, seorang pengacara di Portugal yang mengepalai komunitas Reddit dan merupakan bagian dari dewan penasihat proyek ini.

"Fakta bahwa siapa pun, di rumah, melalui komputernya, bisa memainkan peran dan membantu memerangi (penyakit) demi kebaikan bersama adalah pesan yang kuat," kata Valadas kepada AFP.